办理健康证要五个工作日进行领取，办理流程如下：
1、带身份证和个人免冠一寸彩色照片2张，到收费处缴纳体检费，领取体检表，粘贴照片（另一张领健康证用）、填写好姓名、性别等基本情况；
2、检验室采血、大便肛拭化验；
3、内、外科常规体检；
4、x光胸透；
5、完成全部体检项目；
6、查体结果符合发放健康证条件的，经卫生监督机构组织的卫生法律法规知识培训合格后，发放健康证。查体结果不符合发放健康证条件的，不予办理健康证。
办理程序：
1、对象：从事食品、饮用水生产经营人员、化妆品生产人员、公共场所直接为顾客服务人员。凡患有痢疾、伤寒、病毒性肝炎等消化道传染病（不包括病原携带者），活动性肺结核，化脓性或者渗出性皮肤病以及其他有碍食品卫生、公共卫生的疾病的，治愈前不得从事接触直接人口食品或直接为顾客服务的工作；
2、主要检查项目：病毒性肝炎、痢疾、伤寒、活动性肺结核、皮肤病、内外科常规、X光胸透、粪便细菌学培养（某些地区无此项）等；
3、体检和流程：统一使用卫生部制定的《中华人民共和国预防性健康检查用表》，按照卫生监督机构确定的人员到健康体检单位进行预防性健康检查。
法律依据：《预防性健康检查管理办法》第十条
各级卫生监督机构应制定预防性健康检查工作计划。
第十一条
受检单位应按规定向卫生监督机构提交受检人员名单，并由受检单位负责建立个人健康档案。
第十二条
承担健康检查的单位根据卫生监督机构确定的受检人员名单，按规定的应检项目安排健康检查。具体健康检查工作按国家有关技术规范进行。
第十三条
健康检查单位应将受检人员的检查、检验等原始记录及健康检查结果报送卫生监督机构。
第十四条
卫生监督机构根据健康检查结果，对预防性健康检查合格者签发健康合格证明。对不合格者提出处理意见并监督执行。原始材料同时交受检单位或规定的存档单位存档。
第十五条
卫生监督机构须按年度将管辖范围内的预防性健康检查情况统一汇总、分析并及时报送当地卫生行政部门和上级卫生监督机构。